27 июня 2025 года в Армении разгорелся новый виток противостояния между властями и Армянской апостольской церковью (ААЦ). Сотрудники Службы национальной безопасности (СНБ) провели операцию в Первопрестольном Святом Эчмиадзине, духовном центре ААЦ, с целью задержания архиепископа Ширакской епархии Микаэла Аджапахяна, которого Генпрокуратура Армении обвиняет в призывах к насильственному захвату власти. Утром силовики прибыли в резиденцию Аджапахяна в Гюмри для проведения обысков, но, не обнаружив его там, направились в Эчмиадзин, где расположена резиденция католикоса всех армян Гарегина II. Действия силовиков вызвали стычку с духовенством и прихожанами, что обострило и без того напряжённые отношения между премьер-министром Николом Пашиняном и церковью.

Конфликт начался с обвинений Генпрокуратуры в адрес Аджапахяна, которого связывают с оппозиционным движением «Священная борьба», возглавляемым архиепископом Багратом Галстаняном. Следственный комитет Армении утверждает, что с ноября 2024 года движение планировало теракты и захват власти, не сумев достичь целей законными методами. Аналогичные обвинения предъявлены российскому бизнесмену армянского происхождения Самвелу Карапетяну, главе группы «Ташир», арестованному 18 июня за публичные высказывания в поддержку ААЦ. Карапетян, награждённый в 2024 году орденом «Сурб Эчмиадзин», заявил о готовности защищать церковь «по-своему», что власти расценили как угрозу.

В Эчмиадзине ситуация накалилась, когда спецназ СНБ в масках попытался войти в резиденцию католикоса. Священники и прихожане, собравшиеся у ворот, оказали сопротивление, что привело к потасовке. Как сообщает Sputnik Армения, журналистов, находившихся во дворе, силовики вывели, а прихожане начали читать молитвы в знак протеста. Католикос Гарегин II созвал экстренное совещание духовенства, чтобы обсудить действия властей. Выйдя к собравшимся, он объявил, что Аджапахян согласился поехать на допрос в сопровождении адвоката Миграна Погосяна. По данным News.ru, архиепископ назвал действия властей «беззаконием», заявив, что «главная угроза для Армении сидит в правительстве».

Задержание Аджапахяна стало частью кампании Пашиняна против ААЦ, начавшейся после поражения в Карабахской войне 2020 года. Премьер обвиняет церковь в связях с «преступным режимом» прежних властей и требует отставки Гарегина II, утверждая, что тот нарушил обет безбрачия, имея ребёнка. BBC отмечает, что Пашинян с мая 2025 года публикует оскорбительные посты в соцсетях, называя храмы «чуланами с рухлядью» и обвиняя духовенство в коррупции. Жена премьера Анна Акопян дошла до обвинений в педофилии, что вызвало возмущение верующих.